彭玮

【来源:信自院 | 发布日期:2021-08-22 】

基本信息

姓名

彭玮

系、部门

计算机系

职称/职务

教授

导师类别

博士生导师

学位

博士

电话


电子邮箱

weipeng1980@126.com

办公地点

云南省计算机技术应用重点实验204室

研究方向

机器学习、数据挖掘、生物信息学、医学图像、大数据等

个人情况简介

彭玮,教授,博士,博士生导师,云南省”兴滇英才支持计划”入选者。从事的研究方向主要是机器学习、数据挖掘、生物信息学、医学图像、大数据等。针对海量、多维的生物医药大数据,设计图论与组合优化算法、数据挖掘与机器学习算法等对高通量多组学数据进行挖掘,解决与复杂疾病相关的基因功能预测、非编码RNA识别、药物靶标识别以及微生物的识别等问题,开发相关工具软件供生物医学人员使用。在Bioinformatics、Briefings in Bioinformatics、IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (TCBB)、IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics(JBHI)、BMC Systems Biology、BMCGenomics等国际权威的SCI期刊或国际高水平EI会议上发表学术论文50余篇。主持国家自然科学基金3项,云南省应用基础研究重点项目及面上项目各1项、云南省兴滇人才青年人才项目1项、云南省级人才培养项目1项。获得云南省科技进步一等奖1项。出版学术专著1部,授权发明专利1项,获软件著作权2项。参与了云南省政协、社保、大理政协等政府机关和企事业单位的横向合作项目10余项。是bat365在线平台先进计算软件技术与应用云南省级创新团队的主要成员。中国计算机学会生物信息学专业委员会委员,中国自动化学会智能健康生物信息专业委员会委员,生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会委员,ACM SIGBio专业委员会委员。参与组织GIW2019,InCoB 2021,BIBM,ISBRA,CBC等多项国内外会议。担任TCBB,BIB, BMC bioinformatics等期刊的审稿人。

学习工作经历

1998-2002年本科毕业于bat365在线平台计算机科学与技术专业。

2002-2005年硕士研究生毕业于bat365在线平台计算机应用技术专业。

2010-2013年博士研究生毕业于中南大学信息科学与工程学院计算机应用专业

2015-2016年在佐治亚州立大学,计算机系,访问学者。

代表性成果每类不超过10个

(1)获奖情况

1、快速可定制柔性调度生产物流系统,云南省科技进步一等奖,2015-2-15,排名第6

2、论文“Computational approaches for prioritizing candidate disease genes based on PPI networks”(Tsinghua Science and Technology, 2015, 20(5):500-512)获得了Tsinghua Science and Technology 2016年最佳论文奖。

3. 2017年获bat365在线平台“红云园丁奖”

2教学/科研项目

1. 国家自然科学基金面上项目,基于异质属性网络表征学习的识别癌症驱动基因算法研究(No. 61972185),2020.1-2023.12,课题负责人

2. 国家自然科学基金地区科学基金项目,融合功能元素网络的肿瘤异质性推断算法研究 (No. 31560317),2016.1-2019.12,课题负责人

3. 国家自然科学基金青年科学基金项目,基于多生物网络的蛋白质功能预测算法研究 (No. 61502214),2016.1-2018.12,课题负责人

4. 云南省应用基础研究重点项目,融合多生物网络的疾病相关miRNA识别算法研究 ,2019.10- 2022.10,课题负责人

5. 云南省”兴滇英才支持计划”项目,集成多元生物信息的癌症驱动基因识别算法研究,2019.01-2023.12,课题负责人

6. 云南省应用基础研究面上项目,基于动态蛋白质相互作用网络的关键蛋白质识别方法及应用研究(No. 2016FB107),2016.10- 2019.09,课题负责人

7. bat365在线平台省级人才培养项目,基于随机游走模型的蛋白质网络分析及应用研究(KKSY 201413076),2014.06-2017.05,课题负责人

3)论文

1.Wei Peng*, Hancheng Liu, Wei Dai, Ning Yu, Jianxin Wang,“Predicting cancer drug response using parallel heterogeneous graph convolutional networks with neighborhood interactions”, Bioinformatics, 2022, btac574

2.Wei Peng*, Qi Tang, Wei Dai, Tielin Chen, Improving cancer driver gene identification using multi-task learning on graph convolutional network, Briefings in Bioinformatics, 23, no. 1 (2022): bbab432

3.Wei Peng*, Tielin Chen and Wei Dai, "Predicting Drug Response Based on Multi-omics Fusion and Graph Convolution," IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics, 26, no. 3 (2021): 1384-1393.

4.Wei Peng*, Sichen Yi, Wei Dai, and Jianxin Wang. "Identifying and ranking potential cancer drivers using representation learning on attributed network." Methods 192 (2021): 13-24.

5.Junrong Song, Wei Peng *,Feng Wang,An Entropy-based method for identifying mutual exclusive driver genes in cancer. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics(TCBB),2019,17(3): 758-768.;

6.Junrong Song, Wei Peng*, Feng Wang, "A random walk-based method to identify driver genes by integrating the subcellular localization and variation frequency into bipartite graph", BMC Bioinformatics, 2019, May, 14, 20, 1, 238

7.Wei Peng*, Wei Lan, Jiancheng Zhong, Jianxin Wang, Yi Pan, A novel method of predicting microRNA-disease associations based on microRNA, disease, gene and environment factor networks.[J]. Methods, 2017, 124:69.

8.Wei Peng, Min Li, Lu Chen and Lusheng Wang,Predicting protein functions by using unbalanced random walk algorithm on three biological networks, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics(TCBB), 2017, 14(2): 360-369.

9.Wei Peng, Jianxin Wang, Bihai Zhao and Lusheng Wang,Identification of protein complexes using weighted PageRank-Nibble algorithm and core-attachment structure, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (TCBB), 2015, 12(1): 179-192.

10.Wei Peng, Jianxin Wang, Weiping Wang, Qin Liu, Fang-xiang Wu, Yi Pan,Iteration method for predicting essential proteins based on orthology and protein-protein interaction networks. BMC Systems Biology,vol 6(1),pp.87, 2012

4)知识产权

1、专利:王建新, 成颖佼, 彭玮, 李敏. 一种基于结构域特征的关键蛋白质识别方法. CN201210282873.7

2、专利: 彭玮,李霞, 戴伟. 一种基于胶囊神经网络和集成学习的关键蛋白质识别方法.CN111584010B

3、软件著作权:彭玮,李论,张晓丽,赵一,多生物数据分析平台V1.0,2018SR179492

4、软件著作权:张丰羽,彭玮,张晓丽,彭建军,生物信息学学术论文爬虫系统V1.0, 2018SR595031

5)专著、教材

彭玮,基于随机游走模型的蛋白质网络研究,云南大学出版社,2017.8.1

主讲课程

《数据可视化技术》、《Python程序设计》、《C程序设计语言》、《Java程序设计语言》

指导学生竞赛

2020年、2021年指导本科生参加大学生计算机设计大赛,获得省二等奖1项,省三等奖1项。

2017级硕士研究生张丰羽获国家奖学金.

2018级硕士研究生杜杰霖、易思陈获国家奖学金.

2019级硕士研究生陈铁林获国家奖学金.